Laboratorium Rekayasa Transportasi semula menjadi satu dan merupakan pengembangan dari laboratorium Jalan Raya Program Studi Teknik Sipil Fakultas Teknik Sipil dan Perencanaan UII. Pada tahun 2009, setelah peralatan pendukung, baik perangkat keras maupun perangkat lunak cukup memadai dan mampu berdiri senndiri, maka Laboratorium Rekayasa Transportasi dipisah dari Laboratorium Jalan Raya. Walaupun masih baru, laboratorium ini didukung oleh tenaga ahli dan surveyor yang professional dalam bidang Sistem Transportasi.

Laboratorium Transportasi dalam bidang akademik ditujukan untuk kegiatan praktikum dalam rangka pengenalan, pengetahuan survey dan analisis bidang transportasi dan lalu lintas. Dalam rangka pengembangan laboratorium diarahkan pada bidang perencanaan, perancangan, manajemen, pengawasan, dan pengevaluasian studi transportasi dan lalu lintas, serta pelatihan software. Sehingga dapat dikatakan Laboratorium Rekayasa Transportasi selain melayani kegiatan akademik, juga melayani kegiatan kerjasama dan pengabdian masyarakat.